异构基因共表达网络的分析方法

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内容简介

前言

第1章 绪论

第2章 基于张量的异构信息网络建模方法

2.1 异构信息网络

2.2 张量代数的基本概念

2.3 基于张量的异构信息网络建模

2.4 本章小结

第3章 LncRNA-mRNA基因共表达异构信息网络构建

3.1 引言

3.2 基因共表达网络建模基础

3.3 数据采集

3.4 LncRNA-mRNA基因共表达网络

3.5 LncRNA和mRNA基因共表达模块发现

3.6 LncRNA和mRNA基因共表达分析与讨论

3.7 本章小结

第4章 基于遗传算法的基因共表达网络社团结构发现

4.1 引言

4.2 理论基础

4.3 CDGA算法描述

4.4 社团划分实验结果与分析

第5章 基于一般网络模式的鼻咽癌基因共表达网络聚类

5.1 引言

5.2 基于张量分解的聚类框架

5.3 基于TUCKER分解的聚类模型分析

5.4 实验与结果分析

5.5 本章小结

第6章 稀疏性约束下鼻咽癌基因共表达网络聚类

6.1 引言

6.2 稀疏性约束下的LncRNA-mRNA基因共表达网络聚类框架

6.3 基于CP分解的聚类模型分析

6.4 实验与结果分析

6.5 本章小结

第7章 动态异构信息网络中的混合多类型社团发现

7.1 引言

7.2 基于张量分解的混合多类型社团发现框架

7.3 基于CP分解的混合多类型社团发现模型分析

7.4 实验与结果分析

7.5 本章小结

附录A 鼻咽癌中差异表达LncRNA基因芯片原始结果

附录B 鼻咽癌中差异表达mRNA基因芯片原始结果