福建防御与广东不同。广东主要是将倭寇拒之于海中岛屿,福建则在海岸。海岸不仅要防御倭寇,而且还要防范来自内部的不法之民。不法之民产生的根源,在于福建山多田少,百姓余粮不多。加之倭寇侵扰,海禁随之兴起,本来以土地和贩卖为生的百姓只能铤而走险。所以,经略福建的权宜之计,在于筹备粮食;经略福建的长久之计,是修复卫所制主导下的海防体系,使沿海百姓生活有所依靠,不作倭寇的内应。