昂丹司琼常见的不良反应可有头痛、腹部不适、便秘、口干、皮疹，偶见支气管哮喘或过敏反应，但多数情况下上述反应轻微，如果反应较重，影响正常生活需及早到医院就诊。个别患者可以出现癫痫发作、胸痛、心律不齐、低血压及心动过缓，需停用药物，尽早到医院就诊。

昂丹司琼的禁忌证包括对本药过敏以及胃肠道梗阻。