医学科研思维与方法
上QQ阅读APP看书,第一时间看更新

第三节 医学文献的管理

文献的查阅是科研工作必不可少的环节,而随着科学技术和信息技术的发展,信息资源增长速度迅猛。面对海量的信息资源,尤其是电子文献资源,科学的检索、收集和整理等管理技巧对科技工作者而言显得至关重要。同时,在论文撰写的过程中,需要用到大量的文献资料,而且要进行繁琐的编辑及格式转换等,这需要消耗大量的时间和精力。因此,迫切需要一种科学的工具来统筹管理日益增多的文献资料。随着电子计算机技术的快速发展,文献管理软件应运而生。文献管理软件又叫书目管理软件,它集文献检索与整理、引文标注、全文下载、格式化参考文献列表等多种功能于一身,可嵌入文字处理软件中使用,并直接与在线数据库互动以统计分析文献题录等,为科研工作者提供了良好的文献管理平台。相对而言,文献管理软件在国外的影响比较大,普及面比较广,软件发展也较为成熟,而在国内尚处于起步阶段,但也得到越来越多科研人员的认同。
一、文献管理工具的基本功能
(一)文献信息的收集
文献管理软件最基本的功能就是能集中收集文献信息,以多种方式检索许多大型的数据库,并能将检索到的题录导入到自己建立的文献库中。软件中建立的个人文献数据库,可以分门别类管理文献资源,并能加以整合,剔除重复信息。软件中的数据库也容易携带、备份等。目前几乎所有的大型数据库、图书馆等文献资料的获取都通过相应的文献管理软件来实现,显著提高了文献检索的效率。
(二)文献信息的管理和阅读
文献资料经文献管理软件收集后,我们可以根据自己的需要有效地管理,比如按不同的关键词、不同年份、不同作者、不同主题等分别归类文献资源,并适当加以标记。软件中的文献题录可与本地电脑相关文献全文等原文件建立直接关联,通过文献管理软件就可以直接打开阅读,并且对收集到的文献资料进行一定的统计分析。此外,目前主流的文献管理软件都强化了软件的文献阅读功能,可以加标注,可以记笔记等。
(三)论文模板及引文编辑功能
大部分主流文献管理软件提供了国内外一些知名期刊的写作模板,极大地方便了科研工作者的论文撰写。文献管理软件还能自动进行文末参考文献的编辑,它可以根据文献出现的先后顺序自动编号,并在插入新的文献时自动更新,根据指定的格式将引用的文献附在文章的最后。论文投稿前,可以根据不同的期刊要求,批量更换参考文献的格式,为论文编辑提供了便利。
二、常用文献管理工具介绍
随着计算机技术的发展,文献管理软件也层出不穷,种类也越来越多。目前国内外已有的文献管理软件有数十种,较常见的国产软件有NoteExpress、NoteFirst、医学文献王和新科学等;国外的文献管理软件起步比较早,种类也比较多,常见的有EndNote、Quosa、Jabref、Bibus、Mendeley、Zotero、Citeuliket和Connotea等。这里简单介绍NoteExpress和EndNote两种。
(一)NoteExpress
NoteExpress是由北京一家公司自主研发、拥有完全知识产权的文献检索、管理与应用系统,该软件支持多种文字处理软件,全面支持简体中文、繁体中文和英文,其界面简洁,功能简单、实用,比较好地兼容国内中文文献数据库,还提供了如文献信息统计分析、标签、笔记、附件的添加等功能,便于科研人员对科技文献进行深入的分析和使用,适合国人习惯,目前在国内深得科研人员青睐。NoteExpress最早版本于2005年4月15日发布,现在版本为NoteExpressV3.1,新版本更好地支持了双语参考文献。
NoteExpress的核心功能主要有:
1.数据收集
用户在浏览专业数据库(列表附后)或普通网页时,可以通过插件保存题录及全文或普通网页内容到NoteExpress;手机应用“青提文献”与NoteExpress的协同功能,追踪某方面研究的最新进展,利用碎片时间进行文献收集,并最终归集到自己的NE中。内置常用电子资源库的接口,可以快速下载大量题录(文摘),针对性下载对读者有价值的全文。NoteExpress支持数以百计的全球图书馆书库和电子数据库,如万方、维普、期刊网、Elsevier、ScienceDirect、ACS、OCLC、美国国会图书馆等。一次检索,永久保存。
2.文献管理
分门别类管理电子文献题录以及全文,海量数据,井然有序。拥有独创的虚拟文件夹功能更适合多学科交叉的现代科研需要。
3.文献分析
对检索结果进行多种统计分析,使研究者更快速地了解某领域里的重要专家、研究机构、研究热点等,从而做到有的放矢,事半功倍。
4.阅读与笔记
综述阅读方式,快速发现有价值的文献,与文献相互关联的笔记功能,能随时记录阅读文献时的想法,方便以后查看和引用。检索结果可以长期保存,并自动推送符合特定条件的相关文献,为长期跟踪某一专业的研究动态提供了极大方便。
5.论文写作
支持Word以及WPS办公软件,在论文写作时自动生成符合要求的参考文献索引,使繁琐工作,一键完成。软件内置3000种国内外期刊和学位论文的格式定义。首创的多国语言模板功能,可以自动根据所引用的参考文献语言进行不同差异化输出。
(二)EndNote
EndNote专门用于管理参考文献,也是现在最有名、历史最悠久的国外文献管理软件之一,每年更新一版,每次都有一些功能上的改进,目前最新版本为EndNoteX7。
EndNote能够很好地和WOK平台上的数据库相关联,通过Internet将PubMed等数据库的检索结果直接保存到自己的数据库中,或读入各种格式的Medline检索结果。通过插件方便地在Word中插入所引用的文献,并能生成指定格式的参考书目列表。EndNote支持国际期刊的参考文献格式有近4000种,写作模板几百种,涵盖各个领域的杂志。可以方便地使用这些格式和模板,EndNote可直接连接上千个数据库,并提供通用的检索方式,提高了科技文献的检索效率,并且管理的数据库没有上限,至少能管理数十万条参考文献到Word编辑器中。
EndNote的基本功能主要包括:
1.资源整合
EndNote内置的搜索引擎提供了互联网上1500多种数据库的接口,包括著名的WebofScience、PubMed、Ovid等,只要打开预定义的连接文件,就可以方便地进行在线搜索。支持Z39150标准,可以检索全球所有支持此标准的数据库。针对检索到的数据,EndNote提供了600多个导入过滤器,并允许用户自行添加,帮助用户把不同数据库的检索结果直接导入应用程序之中,从而快速创建个人数字图书馆。
2.文献管理
EndNote支持多种文献类型的存储,包括书目、图像、PDF文件等,并且可以根据需要对存储的记录进行查找、编辑、排序、统计、查重、添加笔记、全文管理(PDF、图片、表格及其他文件)、链接转换、数据库输出以及合并数据库等操作,实现个人图书馆的有效组织和管理。
3.论文模板
EndNote提供了内建的Word模板,该模板预先定义好了包括EN的格式引用、参考文献和图形列表等在内的一篇完整稿件需要具备的所有关键元素,能够协助用户进行稿件的创建,帮助用户通过出版商对稿件的严格要求。EN目前提供了180多种刊物的论文模板供用户选择使用。
4.文献引用
EndNote与Word无缝集成,利用“cite while you write”技术可以在Word文档中定位引用参考文献,自动生成引用标记和规范的、符合出版版式的参考文献格式,并可即时查看生成的参考书目。到目前为止,EN已提供了超过2800种重要期刊的引用及参考文献著录格式,涵盖了如人文科学、生物医学、物理、生命科学和社会科学等多个领域,并可以轻松处理一些参考文献的特殊格式,如作者名或标题首字母大写,在同一文献编号下将多个参考书目编组等。
(莫中成 唐朝克