近年来，基因技术的飞速发展，使得研究遗传与肥胖的关系成为可能。2007年Frayling等人首次发现与体重指数 （BMI）存在关联的FTO基因 ^[11]，引发了肥胖全基因组关联研究 （GWAS）的热潮。　随后发现了 MC4R、FAIM2、NPC1、BDNF、GNPDA2、TMEM18、KCTD15、GNPDA2、SH2B1、MTCH2、NEGR1等多种与肥胖相关的基因。以FTO基因为例，携带单核苷酸多态性位点 （SNP） FTO rs9939609两个危险等位基因AA的纯合突变个体，发生超重及肥胖的风险增加67%；即使该位点基因型是杂合突变 （TA）的个体，发生超重及肥胖的风险也要增加32% ^[12]。一般认为，年龄越小发生的严重肥胖个体，越有可能携带了与肥胖发生相关的基因突变 ^[13]。

研究发现，父母的体重情况可以通过遗传因素影响子女超重及肥胖的发生，父母双方都肥胖的儿童，发生肥胖的风险高于父母双方都不肥胖的儿童。2016年，马军等在北京市749名7～15岁学生中进行的研究发现，父母双方都超重或肥胖、仅父亲超重或肥胖、仅母亲超重或肥胖的儿童发生超重或肥胖的危险分别是父母双方都是正常体重的儿童的4.0倍、3.1倍和2.7倍。