自体造血干细胞移植在患者疾病获得完全缓解以后进行，一般可分为三个阶段：①造血干细胞动员、采集与冻存；②预处理（大剂量放/化疗）；③造血和免疫重建。以霍奇金淋巴瘤和（或）非霍奇金淋巴瘤为例，患者经过化疗获得完全缓解后，利用环磷酰胺联合粒细胞集落刺激因子将患者骨髓中的造血干细胞/祖细胞动员到外周血，然后用血细胞分离机采集CD34 ⁺造血干细胞/祖细胞，采集的造血干细胞/祖细胞的数量要达到2×10 ⁶/kg。然后采用二甲基亚砜、羟乙基淀粉和人血白蛋白在-80℃超低温冰箱冻存造血干细胞。患者进入层流病房接受大剂量放/化疗后，回输复苏后的冻存造血干细胞，这些造血干细胞在患者体内重建造血功能和免疫功能，进而达到治疗/治愈淋巴瘤的目的。