呼吸系统并发症是小儿麻醉最常见的并发症，主要由于呼吸抑制、呼吸道阻塞及氧供应不足所致，可发生于术中及术后，处理原则包括：清除呼吸道分泌物，进行辅助呼吸以及增加氧供应。

小儿呼吸容易受到抑制，术前用药过量或患儿对术前药有高敏反应即可引起呼吸抑制。应用肌松药后必须加强呼吸管理及监测，术后呼吸抑制可由多种原因导致，全麻过深或肌松药残余作用最为常见，应针对原因进行处理。

呼吸道阻塞在小儿麻醉时很常见，舌后坠及分泌物过多是上呼吸道阻塞的常见病因。喉痉挛是小儿麻醉期间常见并发症，多因浅麻醉下局部刺激（机械性或分泌物）所致，经吸氧或加深麻醉丙泊酚1～2mg/kg缓解，严重喉痉挛需行面罩加压氧辅助呼吸，如无效，应及时用肌松药（琥珀胆碱1.0～2.0mg/kg或维库溴铵0.8～ 1mg/kg）静脉注射后进行气管插管。胃内容误吸、支气管痉挛是下呼吸道阻塞的常见原因。支气管痉挛时呈吸气性呼吸困难，很快出现低氧血症和二氧化碳蓄积，进而引起血流动力学的改变。一旦发生支气管痉挛，可静注阿托品、氨茶碱或地塞米松，也可选用异丙肾上腺素稀释后雾化吸入。

麻醉期间的反流、误吸可造成下呼吸道严重阻塞。麻醉时面罩下加压供氧时下颌未托起或托起不当，常致胃内压增加造成反流，多数麻醉药也可以增加胃-食管反流的可能性。麻醉期间可引起呕吐的原因较多，包括饱胃、术前禁食时间不足、麻醉药物的影响、麻醉及手术操作刺激、术后疼痛及缺氧和低氧血症。误吸可发生在麻醉诱导时、术中以及术后的任何阶段。婴儿神经系统发育不完善，保护性反射能力较弱等原因，误吸的发生率高。对于误吸应以预防为主。小儿麻醉前应禁食6小时，禁水4小时。对急诊患儿病情危急禁食时间不够者按饱胃处理。选择快速诱导气管插管。诱导过程中应尽量减少咽喉刺激的发生。一旦发生呕吐或反流，应立即将患儿头部放置右侧位，充分有效吸引，防止误吸。对发生严重误吸者，应行气管插管，并立即生理盐水冲洗气管内。必要时应用呼吸末正压通气。适当应用抗生素预防和治疗误吸后的肺部感染。激素应用存在争议，目前主张早期大剂量短疗程使用。

所有婴儿特别是早产儿，容易出现术后呼吸暂停。常见原因包括患儿脑干发育不全导致对高碳酸血症与低氧血症的通气反应异常，肺不张、低温和吸入麻醉药或麻醉性镇痛药等因素，进一步抑制患儿对高碳酸血症与低氧血症的通气反应而造成通气不足。因此，推荐胎龄低于44～46周早产儿，术后至少应该严密观察18～24小时。