微生物育种是运用遗传学原理和技术对菌种某个特定生产性状进行改造,去除不良性质,增加有益新性状,从而提高目标产品的产量、质量或降低发酵生产成本。微生物育种最终目标是通过人工干预,不断改良微生物菌种的性能,这方面的工作贯穿微生物应用的所有周期,并随着科技发展而不断进步。