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2.5 双氢键体系
羧酸和酰胺形成典型的八元环双氢键体系(HB-9,HB-6P),脲形成分叉型的六元环双氢键模式(HB-18P),硝基可以形成八元环或分叉型的双氢键体系(HB-15,HB-16),1,2,3-三氮唑也可以形成分叉型的分子间氢键(HB-27P)。这些氢键可以被认为是由单官能团氢键供体和受体形成的。把这些氢键模块并在一起,由刚性的连接片段连接并使得其能够通过结构预组织同向排列,可以产生更强的氢键体系。在生命体系中,A·T(HB-136)和A·U(HB-137)碱基对是最重要的双氢键结合模式,它们是形成DNA和RNA的两对碱基对之一。这两个碱基对都产生两个静电排斥二级作用。脒和1,8-萘啶形成的双氢键HB-138可以形成两个静电吸引二级作用,其稳定性更高。