周允娴临床善于揣穴，形成了独特的选穴和刺穴技巧。她强调在针刺治疗时，选用腧穴必求准确，针刺操作尤须得法。她认为，腧穴效用有其特异性，取穴定位是否准确，选穴、配穴是否恰当，直接影响临床疗效。下面介绍她对腧穴问题的一些看法。

周允娴对穴点与穴区的概念有独到见解。对于腧穴的大小，一般认为是呈点状分布在体表上的，所以也有人把腧穴称为刺激点，但实际上腧穴在体表不仅仅以点状分布，每个腧穴还有一定的深度、大小和范围。根据古人经验和临床实践，可以体察到，同一腧穴由于针刺深浅或方向的不同而表现为不同的效用，如表证宜浅刺以疏邪解表、调和营卫，里证须深刺以调整脏腑之寒热虚实。这些众所周知。

对于腧穴的具体定位和大小，也有两种看法，一种认为腧穴是一个小小的点，主张把腧穴严格地局限在一个很小的点上；另一种认为腧穴的广度很大，甚至认为体表任何部位皆可针刺，而将腧穴扩展至整个体表的“面”上。周允娴认为这两种看法都有片面性。她认为腧穴的具体大小，因其所在部位不同而有所差异，例如耳屏前的耳门、听宫、听会，分别隶属于3条不同的经脉，且位置相近，而耳屏的上切迹距其下切迹一般不超过2cm，故此三穴的最大直径不超过1cm。然而，有些腧穴范围就大一些，如环跳穴，历代针灸典籍均记载其位置在髀枢中，而髀枢在中医学指股关节部的一个解剖位置，可见环跳穴的穴区较大。至于后一种看法，实际上是否定了腧穴的存在和意义。周允娴认为，腧穴既非局限在某一局部的一个狭小的点，亦非一个无限的面，而是根据各腧穴所在部位的具体情况或大或小，并且每个腧穴都有其有效限区，即腧穴的相对特异性，若随意扩大，超出该穴的有效限区，就会影响疗效。

一般来说，在穴区内的最敏感处，就是其最有效的穴点，故可结合“以痛取穴”的方法，在穴区内探查最敏感的部位，并将其作为有效的穴点，进行针刺，以提高疗效。