在上述病症为主的特效穴组之外，要根据患者病情加以辨证取穴治疗。周允娴认为医道虽小，关乎人之生死安危，故行此道者，务必精于识病辨证。识病、辨证为中医诊疗之原始，而辨证是治疗的前提，论治是医疗的手段。只有认清疾病，才可抓住疾病的本质及特征；只有准确辨证，才能确立有效的施治方法。针灸临床中，周允娴虽以经络辨证为指导，但更重视脏腑辨证。她常言“辨证要精辟，治病要求源”，认为中医基础理论以藏象学说为核心，主张围绕脏腑进行辨证，即无论表里、寒热、虚实、阴阳，寻因溯源，最终均需归结于脏腑。如双膝痛，此乃一痹证，系经络病，但多数膝痛患者在中年以后发病，此时肾已渐虚，此时除局部穴、按经取穴、按痹证病因取穴外，应特别注意补肾。