根据结石的化学成分进行分类

临床上较为常见的肝胆结石有胆固醇结石、胆色素钙结石和二者混合的结石等几种类型。

胆固醇结石

多呈灰白色或半透明状，表面或有小颗粒突起，如桑椹样，单个结石常为卵圆形，大者直径可达4cm以上，剖面有放射状条纹，坚硬而质轻，可漂浮于水面。单纯胆固醇结石常见于胆囊之中，也可经胆囊颈管进入胆总管而成为继发性胆总管结石。由于胆固醇结石的成因与肝脏代谢紊乱直接相关，故又称为代谢性结石。

胆色素钙结石

多呈棕红色或深棕色，形如淤泥团块状或残缺管柱状或泥沙样，剖面呈环形层状，中心或有蛔虫残骸，表面不光滑，质软易碎。由于胆色素钙结石的生成多与胆道炎症感染有关，故又称为感染性结石。

混合型结石

由于结石中胆固醇和胆色素钙含量比例不同，表面可呈白色或黄色甚至浅棕色，形状或如玉米或小至米粒，数量可多达数十枚乃至数百枚以上。胆囊内充满混合型结石，可见数枚板栗状、相互吻合的多面体，表面光滑，剖面有黄白相间的环形分层，颇似树木的年轮，同时有由中心向周边放射状与环形分层相交错的条纹。

其他代谢性结石

临床中也会偶见少数纯黑色的结石，其表面光滑，质硬，常呈炭渣样或砂砾样，数量可多达百余粒。有医学报道指出，这种结石的生成多与酒精（慢性）中毒、肝硬化或溶血病有关，亦属于代谢性结石，多原发于无感染的胆囊。

还有一些较为少见的其他化学成分的结石，比如脂肪酸钙结石、碳酸钙结石、多糖类结石及多种复合型结石，生成的原因均与肝脏代谢功能紊乱有关。