许师结合经典经方理论体系的特点，对“病机”进行了内涵非常丰富的定义：（六病）病机，指三阴三阳六病的发生、发展和传变的机理与规律。它包括人体对风寒湿燥火等邪气外侵或内生的反应；人体内水证、火证、气证、血证的形成与转归；卫气营血的消长盈亏、输布转化；胃气的强弱、虚实、寒热；三焦的承奉、制化、通利以及形成三阴三阳六病后病势（病位、病性和病态）的体现。而分析病机的重要方法就是基础病机。
