药用植物亲缘学导论
上QQ阅读APP看书,第一时间看更新

2.4 化学信息学和数据库

可用的甘草属DNA标记序列较少,使得推测系统发育关系比较困难(图2-17)。综合文献报道化合物数据,构建甘草化合物数据库有助于深入系统研究化学成分和化学分类(Xiang等,2012)。利用数据库分类化合物,从而能定量分析甘草各类型化合物的分布。已报道甘草化合物至少422个,5大类,即黄酮、香豆素、三萜、二苯乙烯化合物和其他(表2-5)。目前从各物种分离的化合物,甘草170个、洋甘草134个、胀果甘草52个、云南甘草31个。二苯乙烯化合物单列一类别,二苯甲酰甲烷应属于查耳酮类。该类数据库方便化学分类研究。

图2-17  

图2-17  甘草属(Glycyrrhiza)系统发育树(ML法)

(a)细胞核ITS序列;(b)叶绿体matK序列;(c)叶绿体rbcL序列

甘草(G.uralensis),洋甘草(G.glabra)和胀果甘草(G.inflata)是《中国药典》收录的甘草原植物

最常用于模式识别和分类的ANN(人工神经网络)是自组织映射(SOM)。菊科向日葵族(Heliantheae)、堆心菊族(Helenieae)和泽兰族(Eupatorieae)SLs分子描述符的SOMs明显类似,春黄菊族(Anthemideae)和旋覆花族(Inuleae)相似(Scotti等,2012),这些结果符合Bremer提出的基于形态和分子数据的系统分类。通过SL结构片段或二维表示获得的描述符足以取得显著结果,使用三维表示获得的描述符并不能得到更好的结果。