中医学认为，腧穴并非单纯的组织结构，也是神气活动的场所。临证时要求医者精神专一，不为外界所扰，用针之际也要使患者情绪稳定，精专不散。对此，周允娴在临床具体操作中提倡缓式进针，强调“取皮气，治神气”。取皮气，即毫针在皮肤表面缓缓刺入，既可起到调节脏腑经络气血的作用，又不伤皮部之气，从而调动机体的抗病能力。治神气，由于缓慢进针，可使患者免于神乱气散。正如《标幽赋》所云：“凡刺者，使本神朝而后入；既刺也，使本神定而气随。神不朝而勿刺，神已定而可施。”古人强调的“精神内守”“净神”“恬惔虚无”“养慎”等调心方法即是练气的关键，唯有精神内守，全神贯注，方能使心静气行，经络畅达。如《标幽赋》云：“精其心而穷其法”“目无外视，手如握虎，心无内慕，如待贵人”。

治病治人，有机结合。中医学认为，人法天地，天人合一，天地同媾，人与自然要达到和谐统一，否则即会生病，故有“上医治国，中医治人，下医治病”之说。《素问·上古天真论》提出：“法于阴阳，和于术数，食饮有节，起居有常。”即人要顺应自然，遵循生命顺应自然的规律，协调阴阳，调和脏腑，通畅经络，动静适宜，顺应自然。阴阳和则百病不生，临床中，周允娴持中守一而医百病，将治人和治病相结合，常嘱患者，向其传播顺应自然平衡法则的哲学思想。

针刺施治，重视治神、得气、守气。周允娴临证40余年，运用针刺治疗患者近40余万人次，其针刺手法有四大特点：一是重视治神。周允娴针刺进针前重视治神，要求术者全神贯注，做到“目无外视，手如握虎，心无内慕，如待贵人”；强调心静，调理精神，先治术者之神气，后守神而针刺之。切忌针刺时心神分散，一边进针一边与人谈笑。因此，她在针刺时眼神集中，拇指按压穴位，快速捻转进针，常令患者无痛感，不知不觉针已入穴。二是重用提插，少用捻转。周允娴针刺重用提插、少用捻转之补泻手法是其又一特点。针刺手法虽多，但无论采用何种手法，提插捻转总是其基本手法。她强调捻转进针得气快，进针时捻转快速可减少针痛感，导气之时用提插手法亦加强针感。三是重在得气。得气是其针刺操作手法的要点之一。针刺之效，得气为要，这是先贤的经验体会。在临床针刺中，周允娴强调术者要治神，运用捻转提插导气，同时更重视针刺中患者的针刺得气感，要求术者细心觉查指下针感，体会“轻、滑、慢而未来，沉、涩、紧而已至”的古训。只要术者未有沉、涩、紧之感觉，必须借提插手法导气、引气，让患者得气。重视针感得气，强调气至有效是临证治病要遵循的重要原则之一。四是重于守气。周允娴针刺施治除重视治神、导气、得气外，还强调以候气、守气来提高针刺疗效，认为治疗一些痼疾，非浅刺疾出所及，应重视患者得气后留针守气，以保持患者事实上的针刺感和刺激量，才能取得佳效。因此，其留针常在1小时左右，甚至更长。针刺得气后，多采用静候守气为主。如果患者针刺过程中得气感不是很强，则可静以久留候气、守气，或静以守气、动以候气交替而达守气之目的，以提高临床疗效。